SMP IT Abu Bakar Yogyakarta adalah Lembaga Pendidikan Islam dibawah naungan Konsorsium Yayasan MULIA, sebagai solusi dari keresahan sebagian masyarakat muslim yang menginginkan adanya institusi pendidikan islam yang berkomitmen mengamalkan nilai-nilai islam dalam sistemnya, dan bertujuan agar siswa-siswinya mempunyai kompetensi seimbang antara ilmu kauniyah dan qauliyyah, antara fikriyah, ruhiyah dan jasadiyah sehingga mampu melahirkan generasi muda muslim yang berilmu, berwawasan luas dan bermanfaat bagi umat. Pada tahun 2001/2002 lahirlah SMP Islam Terpadu Pertama di Yogyakarta dengan nama SMP Islam Terpadu Abu Bakar Yogyakarta Islamic Boarding and Full Day School. 9 tahun sudah SMP IT Abu Bakar Yogyakarta telah berkiprah di dunia pendidikan, dan telah meluluskan siswa-siswinya dengan hasil yang memuaskan, baik dari akademik maupun non akademik. Membimbing Sepenuh Hati Agar Sholih dan Berprestasi adalah Motto kami, pendidikan akhlaq, bahasa (Inggris dan Arab) serta Al-Qur’an merupakan program uggulan kami. Semua ini kami upayakan agar SMP IT Abu Bakar Yogyakarta mampu mencetak generasi yang siap mengambil peran-peran strategis dimasa yang akan datang.